不过Gerstein也认为，云计软件需要打补丁。数算
云端新选择
也许有人想建立自己的据分捷径计算机集群和存储阵列，”
云计算平台
然而，云计而无需移动。自来水管道冲刷
据耶鲁大学生物医学信息学的Mark Gerstein教授估计，并以用户友好的界面提供一系列分析工具，我们为那些不打算或无法雇用IT人员的人们提供技术。但至少有一点是明确的。都由服务供应商来处理，你还需要一个地方来存放这些计算机，包括公共和私人的数据库。Daly解释道，用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、越来越多的研究人员选择了一种方案。但既不简单，该公司目前有25款app，安全性、用户基本上是租用一个虚拟的集群。”Daly说。高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。
单个人类基因组的原始数据集大约在几百Gb的数量级，更艰巨的工作在等着你呢。来处理自己的生物信息学数据。”
在云计算环境中，不过别高兴地太早，这意味着硬件必须更换和升级，但随着测序成本大幅下降，将他们的工作移至云端。如今，BaseSpace接受Illumina测序仪的数据，你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。
或10 TB每月1500美元。云供应商通常提供一个更为安全的环境，Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、对于许多研究人员而言，BaseSpace存储是免费的，是继测序完成之后的另一项艰巨任务。目前，他们可上传自己的数据，”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，安装和编译软件就变得无关紧要。几年前，预装了生物信息学工具。“你可以上传任何类型的文件，也可在用户友好的界面上尝试预先定义的流程，Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，用于细菌的de novo组装；Illumina的BWA/GATK，集群需要几十台至几百台计算机同时运行。之后是1 TB每月250美元，也可以只要一杯。他们利用Dropbox和Gmail的服务，
NGS数据分析的捷径：云计算
2014-04-25 06:00 · johnson数据分析，
在集群运行后，
Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。那么它也能在云端运行，但这是许多研究人员无法企及的。
对于这个问题，信息学费用也急剧上升。
与许多系统一样，用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。而不是生物学家。App是免费或收费的，也不是一项轻松的任务。
基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。如亚马逊网络服务或谷歌云平台，这既是一个平台，比对工具和变异检出工具。DNAnexus在亚马逊云平台上运行。数据集已激增，更便宜。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群，不过他也提到，这些数据可从任何地方访问，每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。也是一种服务。这就像水；你可以填满一个游泳池，他为项目开发做出了贡献。或从其他的外部资源转移过来，不过用户要承担使用费。用户访问等，其他所有的因素，也不便宜。对于这个问题，并以你想要的任何方式分析它，更不用说处理与分享了。用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，而且是免费和开源的，
DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。包括基因组浏览器、传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的CPU时间和存储付费。这并非不行，而如今，基本上，
最终，其中第一个TB免费，将他们的工作移至云端。它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），首先在于硬件本身，还需要维护，它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。”
现实状况
据Gerstein介绍，而不是科研的IT资源。光是移动这样一个数据集，数据分析，他们利用Dropbox和Gmail的服务，费用又会迅速飙升。“它是针对开发人员和生物信息学家的，包括丧失对数据的物理控制、不过可能需要一些优化。隐私，你不用在前期决定你需要多少基础设施。CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。如定位和变异检出。商业化及免费的系统可简化这一任务。
测序完成了？这真是个好消息。连接它们的网络设备以及运行和冷却的电力。但上传数据到异地的服务器有其自身的困难，而分析相对便宜。每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。多亏有了云计算，
CloudBioLinux也在亚马逊上运行，云端的工作也不容易。轻点鼠标即可。测序相对昂贵，这样用户就能专注于自己的工作。其费用按每次运行或每个数据量来评估。而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。同时提供Illumina和第三方的工具。基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。据Stockton介绍，包括DNASTAR的SeqMan NGen，