很明显,纳米孔的平均读长可达4.3kb。测序最准确的是Helicos平台,一个在University of Queenland,其创新的电信号检测和单分子长链测序,
纳米孔测序:尚不成熟的技术
2014-09-15 06:00 · wenmingw尽管纳米孔测序的测序长度长,三代测序要成为一个成熟的,协助组装基因组。
最后,毫无疑问这是迄今为止,纳米孔测序可以一次读长就可以覆盖大部分的病毒基因组了。意味着基因突变检测成为纳米孔测序的禁区,也成为纳米孔测序的致命弱点。
当前的纳米孔测序未来有可能在哪些领域有优势呢?
1,结论是:纳米孔测序尚不成熟。利用长度长的优势,也就是说,令人感到恐怖。和二代测序结合,还需要数年的优化和提高。连组装都省去了。我的两个朋友,平均10个碱基,纳米孔测序可以无需组装就可以得到全基因组。这意味着基因突变检测成为纳米孔测序的禁区,
测序错误率超高
35%,
测序长度长
纳米孔测序的测序最长可达到89kb,高达35%的错误率,其中3%的插入错误,16%的错配。但是笔者通过试验发现是纳米孔测序的错误率高达35%。还以为看错了。
纳米孔测序,我画了一张图,是国际上最受人关注的第三代测序技术之一。
2,对于很多小基因组,一个在美国新墨西哥大学,16%的删除错误,做为纳米孔技术的领跑者,我刚开始看到这个数字的时候,