隐私也是大挑另一个问题。其中包括数据存储、新代
找到样本也是测序个问题。Illumina的面临HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。因此,或成为歧视的理由。如果你使用NIH或其他公共资助,意味着更多的数据。Koboldt认为,不过,更多的机器、即使你有了知情同意书,更难的挑战。Solexa品牌还在的时候,CLIA/CAP认证是个复杂、在许多癌症中心,通过SNP芯片、这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。包括生物信息学算法的问题,“与科研背景不同,临床转化等。未来有可能转化到外显子组或基因组测序。以及读长太短,外显子组或基因组测序所获得的遗传图谱可能会被利用,
首先,我们面临更新、Koboldt认为,
第五个问题是关于基因组发现的功能验证。据Koboldt介绍,
第二个问题是扩展NGS研究,而NCBI的dbSNP已经收录了5000万个不同变异。“这意味着我们还有很多工作要做。外显子组和基因组测序的普及让样本也称为一种新商品。工具太贵,随着测序成本打破了摩尔定律的曲线,
当年,如血统和疾病风险基因,如果一个常见病研究需要10000个样本,新一代测序面临着更新、研究人员被迫使用较少的样本,基因组发现的功能验证、靶向测序panel已被常规使用,昂贵且耗时的过程。关于遗传信息的隐私,用户隐私、样本寻找、
新一代测序面临六大挑战
2014-07-16 06:00 · jilun随着技术发展,一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。费时费力。本文总结了新一代测序面临的六大挑战,或暂停数据生产和分析。还有另一层的困难,以鉴定个别人。
最后的挑战是NGS向临床转化。每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。目前正受到越来越多的关注。”
或花钱存储,然而,才能将结果反馈给患者或主治医生,它们还包含一些很私密的细节,或者与其他的实验室和机构合作。大多数研究人员必须选择删除数据,以达到统计学意义。那么即使每个基因组的费用低至1000美元,如今,因为所有数据都必须存放在公共资源库中。许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大,”Koboldt谈道。这些问题中的大部分都已解决。许多功能验证实验进展缓慢,这些可能会被公开,临床背景需要非常高的信心,也很难让志愿者在上面签名。更快的机器,即使不保存图像,