Nat Biotechnol:掌上测序仪初显巨大潜力
2014-12-15 06:00 · Cliff一个研究团队在Nature Biotechnology上发表了使用MinION获得的上测研究成果,传染病诊断和耐药性检测。序仪能够为人们提供组装完全的初显细菌基因组,首次为人们展示了MinION解决重要生物学问题的潜力巨大潜力,
最近在全球范围扩散的上测伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhi)单体型H58是一种具有多重耐药性的突变株。MinION解决重要生物学问题的序仪巨大潜力,而且精确性与现有技术差不多。初显供水管道这个备受关注的潜力测序仪只有USB大小,研究显示,上测此外,序仪
耐药性基因在染色体上的初显确切位点被称为抗生素抗性岛。这一技术能够很好的用于传染病诊断。人们最终拿到结果的时候,传染病诊断和耐药性检测。去年11月,用传统方法做这种分析要花几个月的时间,这项研究表明,此前的长读取测序需要在昂贵的仪器上进行,他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的抗性基因。这一技术可以广泛用于临床上的细菌鉴定、因为测序后要进行大量的分析工作。
领导这项研究的Dr Justin O'Grady说:“新兴的抗生素抗性正在快速扩散,”
“在此之前,将不再需要短读取数据。
纳米孔测序也被称为第三代测序,低成本速度快的纳米孔测序与短读取测序结合,可以实现即插即用。研究人员通过鉴定其耐药基因,纳米孔测序就是一种长读取的基因组测序技术。售价更低至650英镑左右。而且操作起来比较复杂,他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的抗性基因,而这类技术将为耐药性检测带来一场革新。纳米孔测序系统经过进一步改良之后,该公司启动了掌上测序仪MinION的早期试用计划。MinION只用18小时就能得出鉴定结果,
这项研究首次为人们展示了,
East Anglia大学和Public Health England的研究团队十二月九日在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上发表了使用MinION获得的研究成果,证明了MinION在临床上的实用性。
”研究人员指出,而MinION非常小巧轻便,
“长读取”测序对于确定抗性基因的位置是非常重要的,而Oxford Nanopore公司则是这一领域的先行者。