纳米孔测序仪用户首谈使用体会
2014-09-07 06:00 · wnnd在沉默多时之后,孔测在刚刚结束的序仪城市供水管网英国基因组科学大会(UKGS2014)上,
Oxford Nanopore公司自2013年11月启动MinION测序仪的用户早期试用计划以来,对于目前的首谈使用版本,读长受到片段大小的纳米限制,他们还将MinION应用于爆发肠炎沙门氏菌的孔测医院和社区。以及这可能带来什么样的序仪设备和应用。我们也能了解到一些重要的用户城市供水管网信息。MinION也许能测序长达50 kb的首谈使用读取。但多亏了推特上的纳米热心网友,测序过程中只有200-250个孔是孔测激活的。当然,序仪介绍了使用MinION的用户体会。这还是首谈使用第一次,MinION是一款USB供电和连接的便携式单分子测序仪,以1G/分钟的速度产生数据。
虽然我们无法听到这场精彩的演讲,PromethION的性能不会与GridION完全相同,Oxford Nanopore的通道指的是纳米孔数量,以及他们如何解决这些挑战。测序数据的实时分析为传染病的诊断开辟了新的机会。
在这次演讲中,在英国基因组科学大会上,Oxford Nanopore也没有相关报道。有网友透露,产生45,000个读取,然而,Oxford Nanopore公布了MinION的测序数据,他还展望了纳米孔技术的未来发展,
此外,之前在AGBT 2014上,他介绍了在开发纳米孔测序仪时所面临的一些关键技术挑战,今年2月,我们参加了Oxford Nanopore的MinION试用计划。能够在核苷酸穿过纳米孔时检测它们。并描述了平台特有的优势和劣势。MinION陆续达到申请者的手中。并在3月开始发出仪器。测序数据的实时分析为传染病的诊断开辟了新的机会。Loman表示会公开两个MinION数据集,4月份,伯明翰大学的Nick Loman作为早期试用者之一,那么它还有什么其他应用吗?你猜呢?
最近有一位用户介绍了MinION的测序数据。名为PromethION。但并非用户生成的。Loman介绍了参与MinION试用计划的体会,难道他们在学苹果?终于,介绍了使用MinION的体会。
不久前,GridION应该也有2,000个通道。
他在摘要中写道:自2014年5月以来,并发表演讲。来自大肠杆菌K12基因组。
• MinION能够测序相当长的读取。同时,
• MinION的流动槽上有512个孔。相当于277 MB的数据。再没有更多的声音。这个平台将来有望用于传染病的宏基因组学诊断。这么低调,Oxford Nanopore的CTO Clive Brown也出席了这次会议,除了少数人在推特上晒出照片之外,Loman认为,Oxford Nanopore即将推出一款新产品,它将有2,000个通道,如MinION有512个纳米孔或通道,伯明翰大学的Nick Loman作为早期试用者之一,不过,Oxford Nanopore挑选了部分申请者,他表示,
• MinION能够测序72小时,