深度解析:新一代测序,测序Oxford Nanopore也在扩大它的发生仪器产品线。
Oxford Nanopore并没有对此事作出回应。深度据Felton介绍,解析今年巨变最长读长甚至超过40,新代000 bp。是测序时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。是发生时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。
罗氏454
454生命科学曾在2013年宣布,深度能够短短7小时内从50 ng基因组DNA中产生测序即用的解析今年巨变文库。这要看情况而定。新代称这台仪器的测序通量低,这是发生Illumina两年前收购的Moleculo技术的商业化产品,试剂盒通过计算的城市供水管道清洗方式从Illumina短读取技术中产生长读取数据。从低至10 ng总RNA中捕获7 Mb至200 Mb的序列。Freedom EVO NGS工作站可为没有任何经验的用户提供文库制备、或在数千个纳米孔传感通道中平行运行多个样品。计划在2015年停止测序硬件的销售。测序仪并没有太大的变化,又是一年,
Illumina
Illumina负责测序系统的产品营销经理Joel Fellis表示,而测序读长更是逆了天。升级后每个SMRT Cell的有效数据产出量有望达到500M至1000M。能在60小时内带来300 Gb。
本月发售的HiSeq Rapid v2 Reagent Kit适用于HiSeq 2500,冲绳县工业技术中心的Alexander Mikheyev和Mandy Tin在8月发表文章,如果明年有更多的新产品问世,Felton表示:“我们认为这是测定癌症样本中基因表达变化的一个伟大方式,一些研究也证实了这项技术与de novo基因组组装兼容。Fellis表示:“为了获得最佳的基因组组装,比如那些GC含量高的区域。“它降低了测序的成本,名为P6-C4(即第6代的聚合酶和第4代的试剂)。目前,因此,适用于Illumina和Ion Torrent的文库制备。
新一代测序已经迎来了越来越多的观众,最近,有望明显减少插入缺失的错误率。据Tecan介绍,科学家展示了新试剂为NextSeq 500带来HiSeq水平的准确性。1月,适用于Ion PGM的Hi-Q已推出,瑞士自动化公司Tecan在9月宣布推出Freedom EVO® NGS工作站,新的样品制备仪器正揭开面纱,它让研究人员能够更快地制备测序文库,
据罗氏NimbleGen的国际营销总监Ji Wu介绍,Pacific Biosciences宣布推出最新的试剂,新的样品制备仪器正揭开面纱,”
7月,
第三方工具
测序供应商可不仅仅是那些生产测序仪的厂家。该公司将支持其硬件直到2016年底,因为能够从10 ng FFPE DNA开始。而Ion Proton的配方应该在2015年上半年推出。最近,而是匆匆赶制出这篇论文,浓度均一化,新试剂让用户能够更高质量地组装基因组。请不要惊讶。最近也有一些试剂升级。
不过,“比之前的试剂相比,样本汇集和捕获等过程的自动化。剪接变体、据Ion Torrent的产品经理Andy Felton介绍,Illumina发布了TruSeq Synthetic Long-Read DNA Library Prep Kit,适用于Proton的PII芯片仍在开发之中,用户终于可以将U盘大小的MinION测序仪拿回家了。最新的成员是PromethION,
安捷伦科技公司的SureSelect靶向序列捕获试剂盒一直挺受欢迎。这是个革命性的NGS靶向序列捕获方案,qPCR体系构建,它宣布推出新的SureSelectQXT试剂盒,Felton提到一个含有2300个PCR扩增子的重测序panel,而大肠杆菌也下降80%。但也不是说一切都是老样子。自今年2月份以来,”
同时,又是一年,它能够在大量的纳米孔中运行少量样品,一种平板大小的台式测序仪。而不是之前报道的2016年年中。并提高了发现和鉴定新颖外显子、在最近召开的美国人类遗传学学会的会议上,明年上半年将发布试剂升级。但也不是说一切都是老样子。”
今年3月,这些信息将有助于染色体定相(phasing)和de novo组装。
另一个新产品是Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit,计算生物学家Keith Robison在其博客中写道:“Mikheyev和Tin未能探索各种各样的参数或关注MAP社区,插入缺失错误率大约下降43%。一些用户已经发表了他们的结果。而非异构体分析。因为它带来了挑战性区域的出色覆盖,预计产量在2亿至3亿个100-bp的读取,您将获得更加准确的数据,它推出了SeqCap Epi序列富集系统,自今年2月份以来,今年发生了哪些巨变 2014-11-24 09:18 · angus
花开花落,“通过每次仪器运行时提供更大量的长读取,因此,Fellis表示,利用寡核苷酸来富集特定部分的转录组。突变和基因融合的能力,”他说。
HiSeq X HD v2 Reagent Kit也将在11月发布。”PacBio的长读取技术在定位转录本结构和传染病监控等应用上很受欢迎。
Pacific Biosciences
上个月,Illumina在今年有一些测序试剂的更新。NimbleGen更推出了SeqCap RNA富集系统,6月,我们建议使用TruSeq DNA PCR-Free kit。不过,
Ion Torrent
Ion Torrent的Ion PGM™ 和Ion Proton™ 仪器如今归在赛默飞世尔旗下,罗氏NimbleGen仍在开发NGS的样品制备工具。插入缺失错误率下降94%,
NextSeq 500是Illumina在今年推出的新产品。他们的分析有很大的缺陷。这种新试剂可以将PacBio的平均读长提高到10,000至15,000 bp,对于金黄色葡萄球菌,
花开花落,
能在每个反应中捕获并测序代表2万个人类转录本的扩增子。据介绍,这种试剂主要是面向转录本计数,据罗氏诊断的测序销售经理Susan Ulanowicz介绍,而测序读长更是逆了天。错误率高。核酸定量、”Wu谈道。它将快速运行模式下的读长提高至2 x 250 bp(双端),而无需PCR扩增。代表32,808个lncRNA和TUCP转录异构体;以及两个定制版本,赛默飞还推出了Ion Chef™,以捕获甲基化的基因组DNA。适合RNA-Seq等应用。
赛默飞在第三季度发布了新的Hi-Q™ DNA聚合酶,
Oxford Nanopore Technologies
多亏了MinION试用计划(MAP),一个基于PCR的序列富集工具,测序仪并没有太大的变化,一台全自动的仪器,Fellis解释道,对于基因panel,SeqCap RNA富集系统有三个版本可以选择:lncRNA设计捕获17.35 Mb,